杭州市畜牧兽医总站是 2001年经市编委批准建立的一个正处级全民事业单位，主管部门是杭州市农业局。同时挂杭州市动物防疫监督所、杭州市动物检疫站、杭州市农产品检测站牌子。总站编制82人，现有在编人员64人，临时聘用人员65人，合计129人。占地15亩，建有4366m2 的五层办公大楼，集办公、培训和实验室为一体。建有动物疫病诊断监测和畜产品质量安全监测两个先进实验室，仪器设备投资达 1000余万元。还建有1100m2室外运动场。绿化面积占70%，环境优雅，景色怡人。

　　总站内设办公室、计划财务科、动物防疫科、动物检疫科、执法监督科、畜产品安全监测科、报验监管科等7个机构。总站党总支下设三个党支部（2个在职支部、1个退休支部），共有党员34名（其中退休党员6名）。杭州城区的东、南、西、北共建有七个动物防检疫分站，近50名专业技术人员长期奋战在动物防检疫第一线。经过多年引进培养，总站形成了一支稳定的专业技术梯队，拥有众多高学历年轻干部，其中硕士生6名（含在读博士生2名）、本科生6名（含在读硕士生3名）、大专生15名；具有高级专业技术职称9名、中级职称23名。

　　杭州市畜牧兽医总站的主要职责是：负责全市动物防疫计划的制定和实施；负责实施包括人畜共患病在内的动物疫病的预防、控制和扑灭；开展畜禽疑难疾病的诊疗；负责动物及动物产品的检疫和动物防疫监督；受委托实施种畜禽的资源保护、经营许可管理和质量监督；负责农产品（畜产品）、饲料和饲料添加剂、乳品质量检验；受委托实施兽药、饲料和饲料添加剂的生产、经营、使用的依法管理；动物防疫合格证、动物及动物产品检疫证明等的行政许可管理；法律法规赋予或行政主管部门委托的其他牧业行政执法。

 　　杭州市畜牧兽医总站的主要职能：

 　　1.负责全市动物防疫计划的制定和实施；负责实施包括人畜共患病在内的动物疫病的预防、控制和扑灭；开展畜禽疑难疾病的诊疗；

　　2.负责动物及动物产品的检疫和动物防疫监督；

　　3.受委托实施种畜禽的资源保护、经营许可管理和质量监督；受委托实施兽药、疫苗的生产经营许可管理和质量监督；

 　　4.负责饲料和饲料添加剂、乳品质量检验；受委托实施饲料和饲料添加剂的生产、经营进行依法管理；

 　　5.动物诊疗许可证管理；法律法规赋予或行政主管部门委托的其他牧业行政执法；

　　6.农产品安全质量检测。